Genital siğillerin nedeni belirlendikten sonra tedavi uygulanmaktadır. Krem, eksizyon yoluyla çıkarma, elektrokoagulasyon, lazerle buharlaştırma veya cerrahi işlemler gibi tedavi seçenekleri vardır. HPV’den korunmak için çok eşlilikten kaçının.
Lazer yöntemi ile siğiller yakılarak yok edilir günümüzde genellikle tercih edilen lazer tedavisidir. İlaç tedavisinde ise siğiller interferon ve imikimod adlı ilaçlarla tedavi edilir. Likit nitrojen yardımıyla da dondurma işlemi yapılabilir. Bu işlem ağrısız ve acısızdır.